不管用哪个词，玛咖、玛卡都指MACA。
“玛咖”名称来源。官方及研究通用玛咖来称呼MACA。为改善云南高海拔地区农户贫困问题，经过多年研究，找到了玛咖（MACA）这一神奇作物。自玛咖传入中国前，国外一直用MACA（西班牙语，是秘鲁官方语言），学名叫Lepidium meyenii walp。2001年移种到云南丽江，当时命名叫玛咖；经历多年发展后，2011年6月份卫生部13号公告明确了“玛咖”为新资源食品，官方文件同样沿用“玛咖”这一名词。
而“玛卡”在民间流传，猜测是以前山区种植户学历不高，导致将MACA、玛咖听错成“玛卡”，同时加上手写“玛卡”更容易，导致了“玛卡”一词的流行。然而不管怎么样，“玛卡”就这样流行起来了。
规范化：
如果要找寻国外资料，建议用“Lepidium meyenii walp”这一词；
如果要找寻国内资料，建议用“玛咖”这一词，可以获得更多政府、官方信息；
如果跟商家沟通，建议用“玛咖”这一词；
如果是手写，可以使用“玛卡”。但正规文件，建议用“玛咖”这一词。
至于你问为什么要更规范化一些？小编只能说：至少要专业些，免得被坑。